مهمترین هدف در استفاده از نرم افزار مدیریت پروژه ارائه ابزار کنترلی و نظارتی جامع در اختیار مدیران برای طی مراحل پروژه از شروع تا خاتمه است. در این راستا سیستم مدیریت پروژه همزمان با ارائه امکانات تعریف ساختار پروژه (WBS) و ایجاد گانت اجرایی پروژه، جنبه های دیگر پروژه مانند پرسنل مسئول در پروژه، بودجه پیش بینی و واقعی پروژه را نیز در اختیار قرار خواهد داد.
با وجود این امکانات مدیران قادر خواهند بود علاوه بر کنترل کامل در تعریف ساختار پروژه، نظارت جامع بر روند پیشرفت پروژه داشته باشند. همچنین پرسنل مسئول در پروژه در هر سطحی از مسئولیت (مدیران میانی یا پرسنل نهایی) امکانات متناسب با سطوح عملیاتی خود برای ثبت گزارشات کارکرد یا نتایج مدیریتی را خواهند داشت